Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DspE9Q557 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DspE9Q557 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DspE9Q557 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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