Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r88E9Q235 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r88E9Q235 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms