Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms