Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20425E9Q035 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms