Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp54bE9PXC0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms