Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc144bE9PVZ3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms