Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FgaE9PV24 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms