Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930444G20RikD3Z741 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930444G20RikD3Z741 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms