Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kif28pD3YXS5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms