Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cttnbp2B9EJA2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms