Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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