Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71aB7XG49 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms