Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clrn2B2RVW2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms