Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc8B2RUS7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc8B2RUS7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms