Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms