Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrklB2RRL2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrklB2RRL2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrklB2RRL2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrklB2RRL2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrklB2RRL2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrklB2RRL2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms