Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf25B1AWN9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms