Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b5A3FIN4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms