Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Samt1A2BED8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samt1A2BED8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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