Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms