Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms