Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GabreA2AMW3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms