Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms