Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc4a11A2AJN7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc4a11A2AJN7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms