Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms