Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprfA2A8L5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprfA2A8L5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms