Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms