Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms