Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms