Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms