Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt27Q9Z320 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt27Q9Z320 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms