Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac5Q9Z2V6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms