Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms