Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccl27Q9Z1X0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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