Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms