Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms