Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms