Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn13Q9Z0S4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn13Q9Z0S4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn13Q9Z0S4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn13Q9Z0S4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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