Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms