Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stxbp4Q9WV89 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stxbp4Q9WV89 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stxbp4Q9WV89 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stxbp4Q9WV89 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stxbp4Q9WV89 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stxbp4Q9WV89 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stxbp4Q9WV89 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms