Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scnn1bQ9WU38 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scnn1bQ9WU38 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms