Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms