Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sept6Q9R1T4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms