Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrkQ9R0G8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms