Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms