Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms