Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms