Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snai3Q9QY31 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms