Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpsf3Q9QXK7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpsf3Q9QXK7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpsf3Q9QXK7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpsf3Q9QXK7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpsf3Q9QXK7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 324.8 ms