Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msh5Q9QUM7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msh5Q9QUM7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms